A Leon, az Ibiza és a Mii után az Arona a negyedik földgázhajtású modell a Seat kínálatában. A motortérben az egyliteres turbómotor 90 lóerős változata dolgozik, a maximális nyomaték 160 Nm, és egyedüliként hatfokozatú, kézi kapcsolású váltóval párosítják ezt.

Módosítják a padlólemez hátsó részét, hogy a három CNG-tartálynak legyen helye (a csomagtér mérete 282 literre csökken), a betöltőnyílás a tanksapka alatt, a benzinbetöltő-nyílás mellett helyezkedik el. A motoron belül króm-nikkel felületkezeléssel rendelkező dugattyúkat, megerősített szelepeket és szelepfészkeket alkalmaznak, a turbófeltöltő könnyebb a benzinesben használt darabhoz képest. A 14,3 kg tömegű földgáz 400 km megtételére elegendő a szabványos fogyasztással számolva, ehhez jön még 160 km benzinnel.